肝がんは種類が多く、遺伝が強く、再発しやすいため、病気の進行を予測できるバイオマーカーを同定することが肝がんと闘う上での重要な目標となっています。
最近、研究者らは、スプライシングバイオマーカーに基づいて肝臓がん・肝細胞がん(HCC)の最も一般的な形態を特定する方法を開発しました。 彼らは、この方法は他の種類の癌にも使用できると考えています。 この研究は、RNAスプライシング変異体ががんにどのように寄与するかを明らかにし、これらの変異体ががん進行の潜在的なバイオマーカーとなる可能性があることを指摘しています。
スプライシングとは、遺伝子にコードされている情報からコピーされた RNA 情報が、特定のタンパク質マップの作成に使用される前に編集されるプロセスを指します。 遺伝子は複数の RNA メッセージを生成することができ、各メッセージは異なるタンパク質変異体または「異性体」を生成します。 多くの病気は、RNA スプライシング方法のエラーやバリエーションに関連しています。 スプライシングにおけるエラーや変化により、異なる機能や異常な機能を持つタンパク質が生じる可能性があります。
Recent research has identified splicing irregularities in 肝臓がん cells. Krainer’s team has developed a method that can comprehensively analyze all RNA information produced by a given gene. The team tested their methods of detecting splice variants in HCC by analyzing RNA information from HCC cells collected from hundreds of patients.
They found that the specific splicing isoform of the AFMID gene is associated with the patient’s low survival. These variants result in cells making truncated versions of the AFMID protein. These unusual proteins are associated with mutations in TP53 and ARID1A 腫瘍 suppressor genes in adult liver cancer cells.
研究者らは、これらの変異は、損傷した DNA の修復に関与する NAD + と呼ばれる分子の低レベルに関連していると仮説を立てました。 AFMID スプライシングを修復すると、NAD + の生成が増加し、DNA 修復が増加する可能性があります。これができれば、AFMID 縫合は肝臓がんの治療標的となり、新薬の供給源となる可能性があります。予備実験では、チームの研究が正しい方向に進んでいることが示されており、より良いデータ結果が肝臓がん患者に利益をもたらすことが期待されます。