Оскільки рак печінки має багато типів, сильну спадковість і легкий рецидив, визначення біомаркерів, які можуть передбачити прогресування захворювання, є ключовою метою боротьби з раком печінки.
Нещодавно дослідники розробили метод ідентифікації найпоширенішої форми раку печінки - гепатоцелюлярної карциноми (HCC) на основі зрощування біомаркерів. Вони вважають, що цей метод також може застосовуватися при інших видах раку. Це дослідження підкреслює, як варіанти сплайсингу РНК сприяють розвитку раку, та вказує, що ці варіанти можуть стати потенційними біомаркерами для прогресування раку.
Зрощування відноситься до процесу, в якому інформація про РНК, скопійована з інформації, закодованої в гені, редагується перед тим, як її можна використовувати для складання конкретної карти білка. Ген може продукувати кілька повідомлень РНК, і кожне повідомлення продукує інший варіант білка або "ізомер". Багато захворювань пов'язані з помилками або варіаціями методів сплайсингу РНК. Помилки або зміни сплайсингу можуть призвести до білків з різними або аномальними функціями.
Recent research has identified splicing irregularities in рак печінки cells. Krainer’s team has developed a method that can comprehensively analyze all RNA information produced by a given gene. The team tested their methods of detecting splice variants in HCC by analyzing RNA information from HCC cells collected from hundreds of patients.
They found that the specific splicing isoform of the AFMID gene is associated with the patient’s low survival. These variants result in cells making truncated versions of the AFMID protein. These unusual proteins are associated with mutations in TP53 and ARID1A пухлина suppressor genes in adult liver cancer cells.
The researchers hypothesized that these mutations are related to the low level of a molecule called NAD +, which is involved in repairing damaged DNA. Repairing AFMID splicing may lead to increased production of NAD + and increased DNA repair. If we can do this, AFMID stitching can become a therapeutic target and a source of new drugs for liver cancer. Preliminary experiments show that the team’s research is on the right track, and we expect better data results to benefit liver cancer patients.
