Επειδή ο καρκίνος του ήπατος έχει πολλούς τύπους, ισχυρή κληρονομικότητα και εύκολη υποτροπή, ο εντοπισμός βιοδεικτών που μπορούν να προβλέψουν την εξέλιξη της νόσου είναι βασικός στόχος για την καταπολέμηση του καρκίνου του ήπατος.
Πρόσφατα, οι ερευνητές ανέπτυξαν μια μέθοδο για τον εντοπισμό της πιο κοινής μορφής καρκίνου του ήπατος-ηπατοκυτταρικού καρκινώματος (HCC) με βάση βιοδείκτες ματίσματος. Πιστεύουν ότι αυτή η μέθοδος μπορεί να χρησιμοποιηθεί και για άλλους τύπους καρκίνου. Αυτή η μελέτη υπογραμμίζει πώς οι παραλλαγές ματίσματος RNA συμβάλλουν στον καρκίνο και επισημαίνει ότι αυτές οι παραλλαγές μπορεί να γίνουν δυνητικοί βιοδείκτες για την εξέλιξη του καρκίνου.
Το μάτισμα αναφέρεται σε μια διαδικασία κατά την οποία οι πληροφορίες RNA που αντιγράφονται από πληροφορίες που κωδικοποιούνται σε ένα γονίδιο επεξεργάζονται προτού μπορέσουν να χρησιμοποιηθούν για τη δημιουργία ενός συγκεκριμένου χάρτη πρωτεϊνών. Ένα γονίδιο μπορεί να παράγει πολλαπλά μηνύματα RNA και κάθε μήνυμα παράγει μια διαφορετική παραλλαγή πρωτεΐνης ή «ισομερές». Πολλές ασθένειες σχετίζονται με σφάλματα ή παραλλαγές στις μεθόδους ματίσματος RNA. Σφάλματα ή αλλαγές στο μάτισμα μπορεί να οδηγήσουν σε πρωτεΐνες με διαφορετικές ή μη φυσιολογικές λειτουργίες.
Recent research has identified splicing irregularities in καρκίνος στο συκώτι cells. Krainer’s team has developed a method that can comprehensively analyze all RNA information produced by a given gene. The team tested their methods of detecting splice variants in HCC by analyzing RNA information from HCC cells collected from hundreds of patients.
They found that the specific splicing isoform of the AFMID gene is associated with the patient’s low survival. These variants result in cells making truncated versions of the AFMID protein. These unusual proteins are associated with mutations in TP53 and ARID1A όγκος suppressor genes in adult liver cancer cells.
Οι ερευνητές υπέθεσαν ότι αυτές οι μεταλλάξεις σχετίζονται με το χαμηλό επίπεδο ενός μορίου που ονομάζεται NAD +, το οποίο εμπλέκεται στην επιδιόρθωση του κατεστραμμένου DNA. Η επιδιόρθωση του ματίσματος AFMID μπορεί να οδηγήσει σε αυξημένη παραγωγή NAD + και αυξημένη επιδιόρθωση του DNA. Εάν μπορούμε να το κάνουμε αυτό, η ραφή AFMID μπορεί να γίνει θεραπευτικός στόχος και πηγή νέων φαρμάκων για τον καρκίνο του ήπατος. Τα προκαταρκτικά πειράματα δείχνουν ότι η έρευνα της ομάδας βρίσκεται στο σωστό δρόμο και αναμένουμε καλύτερα αποτελέσματα δεδομένων προς όφελος των ασθενών με καρκίνο του ήπατος.