Eftersom levercancer har många typer, stark arv och lätt återfall, är identifiering av biomarkörer som kan förutsäga sjukdomsprogression ett viktigt mål för att bekämpa levercancer.
Nyligen har forskare utvecklat en metod för att identifiera den vanligaste formen av levercancer-hepatocellulärt karcinom (HCC) baserat på splitsning av biomarkörer. De tror att denna metod även kan användas för andra typer av cancer. Denna studie belyser hur RNA-splitsningsvarianter bidrar till cancer, och påpekar att dessa varianter kan bli potentiella biomarkörer för cancerprogression.
Splicing hänvisar till en process där RNA-information kopierad från information kodad i en gen redigeras innan den kan användas för att göra en specifik proteinkarta. En gen kan producera flera RNA-meddelanden, och varje meddelande producerar en annan proteinvariant eller "isomer". Många sjukdomar är relaterade till fel eller variationer i RNA-skarvningsmetoder. Fel eller förändringar i splitsningen kan resultera i proteiner med olika eller onormala funktioner.
Ny forskning har identifierat oegentligheter i skarvning lever cancer celler. Krainers team har utvecklat en metod som heltäckande kan analysera all RNA-information som produceras av en given gen. Teamet testade sina metoder för att upptäcka splitsvarianter i HCC genom att analysera RNA-information från HCC-celler som samlats in från hundratals patienter.
De fann att den specifika splitsningsisoformen av AFMID-genen är associerad med patientens låga överlevnad. Dessa varianter resulterar i att celler gör trunkerade versioner av AFMID-proteinet. Dessa ovanliga proteiner är associerade med mutationer i TP53 och ARID1A tumör suppressorgener i vuxna levercancerceller.
Forskarna antog att dessa mutationer är relaterade till den låga nivån av en molekyl som kallas NAD+, som är involverad i att reparera skadat DNA. Reparation av AFMID-skarvning kan leda till ökad produktion av NAD+ och ökad DNA-reparation. Om vi kan göra detta kan AFMID-sömmar bli ett terapeutiskt mål och en källa till nya läkemedel mot levercancer. Preliminära experiment visar att teamets forskning är på rätt väg, och vi förväntar oss bättre dataresultat till nytta för levercancerpatienter.
