Pretože rakovina pečene má mnoho typov, silnú dedičnosť a ľahkú recidívu, identifikácia biomarkerov, ktoré dokážu predpovedať progresiu ochorenia, je kľúčovým cieľom v boji proti rakovine pečene.
Nedávno výskumníci vyvinuli metódu na identifikáciu najbežnejšej formy rakoviny pečene - hepatocelulárneho karcinómu (HCC) založenú na zostrihu biomarkerov. Veria, že túto metódu možno použiť aj pri iných typoch rakoviny. Táto štúdia zdôrazňuje, ako varianty zostrihu RNA prispievajú k rakovine, a poukazuje na to, že tieto varianty sa môžu stať potenciálnymi biomarkermi progresie rakoviny.
Zostrih označuje proces, v ktorom sa informácie o RNA skopírované z informácií zakódovaných v géne upravia predtým, ako sa môžu použiť na vytvorenie špecifickej proteínovej mapy. Gén môže produkovať viacero správ RNA a každá správa produkuje iný proteínový variant alebo „izomér“. Mnoho chorôb súvisí s chybami alebo variáciami v metódach zostrihu RNA. Chyby alebo zmeny v zostrihu môžu viesť k proteínom s rôznymi alebo abnormálnymi funkciami.
Recent research has identified splicing irregularities in rakovina pečene cells. Krainer’s team has developed a method that can comprehensively analyze all RNA information produced by a given gene. The team tested their methods of detecting splice variants in HCC by analyzing RNA information from HCC cells collected from hundreds of patients.
They found that the specific splicing isoform of the AFMID gene is associated with the patient’s low survival. These variants result in cells making truncated versions of the AFMID protein. These unusual proteins are associated with mutations in TP53 and ARID1A nádor suppressor genes in adult liver cancer cells.
Vedci predpokladali, že tieto mutácie súvisia s nízkou hladinou molekuly nazývanej NAD +, ktorá sa podieľa na oprave poškodenej DNA. Oprava zostrihu AFMID môže viesť k zvýšenej produkcii NAD + a zvýšenej oprave DNA. Ak sa nám to podarí, AFMID šitie sa môže stať terapeutickým cieľom a zdrojom nových liekov na rakovinu pečene. Predbežné experimenty ukazujú, že výskum tímu je na správnej ceste a očakávame, že lepšie výsledky údajov budú prínosom pre pacientov s rakovinou pečene.
