Ponieważ rak wątroby ma wiele typów, silne dziedziczenie i łatwy nawrót, identyfikacja biomarkerów, które mogą przewidywać postęp choroby, jest kluczowym celem w walce z rakiem wątroby.
Niedawno naukowcy opracowali metodę identyfikacji najpowszechniejszej postaci raka wątroby – raka wątrobowokomórkowego (HCC) w oparciu o biomarkery splicingu. Uważają, że tę metodę można zastosować również w przypadku innych rodzajów raka. Badanie to podkreśla, w jaki sposób warianty splicingu RNA przyczyniają się do raka i wskazuje, że te warianty mogą stać się potencjalnymi biomarkerami progresji raka.
Splicing odnosi się do procesu, w którym informacje RNA skopiowane z informacji zakodowanych w genie są edytowane, zanim będzie można ich użyć do stworzenia określonej mapy białkowej. Gen może wytwarzać wiele wiadomości RNA, a każda wiadomość wytwarza inny wariant białka lub „izomer”. Wiele chorób jest związanych z błędami lub zmianami w metodach składania RNA. Błędy lub zmiany w splicingu mogą skutkować białkami o innych lub nieprawidłowych funkcjach.
Ostatnie badania wykazały nieprawidłowości w splicingu rak wątroby komórki. Zespół Krainera opracował metodę, która pozwala kompleksowo analizować całą informację RNA wytwarzaną przez dany gen. Zespół przetestował swoje metody wykrywania wariantów składania w HCC, analizując informacje RNA z komórek HCC pobranych od setek pacjentów.
Odkryli, że specyficzna izoforma splicingowa genu AFMID jest powiązana z niskim przeżyciem pacjenta. W wyniku tych wariantów komórki wytwarzają skrócone wersje białka AFMID. Te niezwykłe białka są powiązane z mutacjami w genach TP53 i ARID1A guz geny supresorowe w dorosłych komórkach raka wątroby.
Naukowcy postawili hipotezę, że mutacje te są powiązane z niskim poziomem cząsteczki zwanej NAD+, która bierze udział w naprawie uszkodzonego DNA. Naprawa splicingu AFMID może prowadzić do zwiększonej produkcji NAD + i zwiększonej naprawy DNA. Jeśli nam się to uda, szycie AFMID może stać się celem terapeutycznym i źródłem nowych leków na raka wątroby. Wstępne eksperymenty pokazują, że badania zespołu są na dobrej drodze i spodziewamy się, że lepsze wyniki danych przyniosą korzyści pacjentom z rakiem wątroby.
