იმის გამო, რომ ღვიძლის კიბოს მრავალი სახეობა, ძლიერი მემკვიდრეობა და მარტივი რეციდივი აქვს, ბიომარკერების იდენტიფიცირება, რომლებსაც შეუძლიათ დაავადების პროგრესირების პროგნოზირება, მთავარი მიზანია ღვიძლის კიბოსთან ბრძოლაში.
ცოტა ხნის წინ, მკვლევარებმა შეიმუშავეს მეთოდი, რათა დადგინდეს ღვიძლის კიბოს ყველაზე გავრცელებული ფორმა - ჰეპატოცელულარული კარცინომა (HCC), რომელიც დაფუძნებულია ბიომარკერების შერწყმაზე. მათ მიაჩნიათ, რომ ეს მეთოდი შეიძლება გამოყენებულ იქნას კიბოს სხვა ტიპებისთვისაც. ეს კვლევა ხაზს უსვამს იმას, თუ როგორ უწყობს ხელს კიბოს წარმოქმნის RNA შესაკრავი ვარიანტები და აღნიშნავს, რომ ეს ვარიანტები შეიძლება გახდეს კიბოს პროგრესირების პოტენციური ბიომარკერები.
Splicing აღნიშნავს პროცესს, როდესაც RNA ინფორმაციის კოპირებული ინფორმაცია გენში დაშიფრული ინფორმაციისგან რედაქტირდება მანამ, სანამ ის გამოყენებული იქნება კონკრეტული ცილის რუკის შესაქმნელად. გენს შეუძლია შექმნას მრავალი RNA შეტყობინება და თითოეული შეტყობინება აწარმოებს განსხვავებულ ცილის ვარიანტს ან "იზომერს". მრავალი დაავადება უკავშირდება რნმ-ის შეხების მეთოდების შეცდომებს ან ვარიაციებს. შეხების შეცდომებმა ან შეცვლამ შეიძლება გამოიწვიოს ცილები განსხვავებული ან პათოლოგიური ფუნქციებით.
Recent research has identified splicing irregularities in ღვიძლის კიბო cells. Krainer’s team has developed a method that can comprehensively analyze all RNA information produced by a given gene. The team tested their methods of detecting splice variants in HCC by analyzing RNA information from HCC cells collected from hundreds of patients.
They found that the specific splicing isoform of the AFMID gene is associated with the patient’s low survival. These variants result in cells making truncated versions of the AFMID protein. These unusual proteins are associated with mutations in TP53 and ARID1A სიმსივნური suppressor genes in adult liver cancer cells.
მკვლევარებმა წამოაყენეს ჰიპოთეზა, რომ ეს მუტაციები დაკავშირებულია მოლეკულის დაბალ დონესთან, სახელად NAD +, რომელიც მონაწილეობს დაზიანებული დნმ-ის აღდგენაში. AFMID სპლაისინგის შეკეთებამ შეიძლება გამოიწვიოს NAD +-ის წარმოების გაზრდა და დნმ-ის შეკეთების გაზრდა. თუ ჩვენ შეგვიძლია ამის გაკეთება, AFMID ნაკერი შეიძლება გახდეს თერაპიული სამიზნე და ახალი წამლების წყარო ღვიძლის კიბოსთვის. წინასწარი ექსპერიმენტები აჩვენებს, რომ გუნდის კვლევა სწორ გზაზეა და ჩვენ ველით უკეთესი მონაცემების შედეგებს ღვიძლის კიბოს მქონე პაციენტებისთვის.