Fordi leverkræft har mange typer, stærk arv og let gentagelse, er identifikation af biomarkører, der kan forudsige sygdomsprogression, et nøglemål i bekæmpelsen af leverkræft.
For nylig har forskere udviklet en metode til at identificere den mest almindelige form for leverkræft-hepatocellulært karcinom (HCC) baseret på splejsning af biomarkører. De mener, at denne metode også kan bruges til andre former for kræft. Denne undersøgelse fremhæver, hvordan RNA-splejsningsvarianter bidrager til cancer, og påpeger, at disse varianter kan blive potentielle biomarkører for cancerprogression.
Splejsning refererer til en proces, hvor RNA-information kopieret fra information kodet i et gen redigeres, før den kan bruges til at lave et specifikt proteinkort. Et gen kan producere flere RNA-meddelelser, og hver meddelelse producerer en anden proteinvariant eller "isomer". Mange sygdomme er relateret til fejl eller variationer i RNA-splejsningsmetoder. Fejl eller ændringer i splejsning kan resultere i proteiner med forskellige eller unormale funktioner.
Recent research has identified splicing irregularities in leverkræft cells. Krainer’s team has developed a method that can comprehensively analyze all RNA information produced by a given gene. The team tested their methods of detecting splice variants in HCC by analyzing RNA information from HCC cells collected from hundreds of patients.
They found that the specific splicing isoform of the AFMID gene is associated with the patient’s low survival. These variants result in cells making truncated versions of the AFMID protein. These unusual proteins are associated with mutations in TP53 and ARID1A tumor suppressor genes in adult liver cancer cells.
Forskerne antog, at disse mutationer er relateret til det lave niveau af et molekyle kaldet NAD+, som er involveret i at reparere beskadiget DNA. Reparation af AFMID-splejsning kan føre til øget produktion af NAD+ og øget DNA-reparation. Hvis vi kan gøre dette, kan AFMID-syning blive et terapeutisk mål og en kilde til nye lægemidler mod leverkræft. Foreløbige eksperimenter viser, at holdets forskning er på rette vej, og vi forventer, at bedre dataresultater vil gavne leverkræftpatienter.
