Vzhledem k tomu, že rakovina jater má mnoho typů, silnou dědičnost a snadnou recidivu, je identifikace biomarkerů, které mohou předpovídat progresi onemocnění, klíčovým cílem v boji proti rakovině jater.
Nedávno výzkumníci vyvinuli metodu k identifikaci nejběžnější formy rakoviny jater – hepatocelulárního karcinomu (HCC) založenou na sestřihu biomarkerů. Domnívají se, že tuto metodu lze použít i u jiných typů rakoviny. Tato studie zdůrazňuje, jak varianty sestřihu RNA přispívají k rakovině, a poukazuje na to, že tyto varianty se mohou stát potenciálními biomarkery progrese rakoviny.
Spojování se týká procesu, ve kterém jsou informace o RNA zkopírované z informací kódovaných v genu upraveny, než mohou být použity k vytvoření specifické proteinové mapy. Gen může produkovat více RNA zpráv a každá zpráva produkuje jinou proteinovou variantu nebo „izomer“. Mnoho onemocnění souvisí s chybami nebo variacemi v metodách sestřihu RNA. Chyby nebo změny sestřihu mohou vést k proteinům s různými nebo abnormálními funkcemi.
Recent research has identified splicing irregularities in rakovina jater cells. Krainer’s team has developed a method that can comprehensively analyze all RNA information produced by a given gene. The team tested their methods of detecting splice variants in HCC by analyzing RNA information from HCC cells collected from hundreds of patients.
Zjistili, že specifická isoforma sestřihu genu AFMID je spojena s nízkým přežitím pacienta. Tyto varianty vedou k tomu, že buňky vytvářejí zkrácené verze proteinu AFMID. Tyto neobvyklé proteiny jsou spojeny s mutacemi v TP53 a ARID1A nádor supresorové geny v dospělých buňkách rakoviny jater.
Vědci předpokládali, že tyto mutace souvisejí s nízkou hladinou molekuly zvané NAD +, která se podílí na opravě poškozené DNA. Oprava sestřihu AFMID může vést ke zvýšené produkci NAD + a zvýšené opravě DNA. Pokud to dokážeme, šití AFMID se může stát terapeutickým cílem a zdrojem nových léků na rakovinu jater. Předběžné experimenty ukazují, že výzkum týmu je na správné cestě a očekáváme, že lepší výsledky dat budou přínosem pro pacienty s rakovinou jater.
