Тъй като ракът на черния дроб има много видове, силно наследяване и лесен рецидив, идентифицирането на биомаркери, които могат да предскажат прогресията на заболяването, е ключова цел в борбата с рака на черния дроб.
Наскоро изследователите са разработили метод за идентифициране на най-често срещаната форма на рак на черния дроб - хепатоцелуларен карцином (HCC) въз основа на сплайсинг биомаркери. Те вярват, че този метод може да се използва и за други видове рак. Това проучване подчертава как вариантите за снаждане на РНК допринасят за рака и посочва, че тези варианти могат да се превърнат в потенциални биомаркери за прогресия на рака.
Сплайсингът се отнася до процес, при който РНК информацията, копирана от информация, кодирана в ген, се редактира, преди да може да се използва за съставяне на специфична протеинова карта. Ген може да произвежда множество РНК съобщения и всяко съобщение произвежда различен протеинов вариант или „изомер“. Много заболявания са свързани с грешки или вариации в методите за снаждане на РНК. Грешки или промени в снаждането могат да доведат до протеини с различни или ненормални функции.
Recent research has identified splicing irregularities in рак на черния дроб cells. Krainer’s team has developed a method that can comprehensively analyze all RNA information produced by a given gene. The team tested their methods of detecting splice variants in HCC by analyzing RNA information from HCC cells collected from hundreds of patients.
Те открили, че специфичната изоформа на сплайсинг на гена AFMID е свързана с ниската преживяемост на пациента. Тези варианти водят до клетки, които правят съкратени версии на протеина AFMID. Тези необичайни протеини са свързани с мутации в TP53 и ARID1A тумор супресорни гени в възрастни ракови клетки на черния дроб.
Изследователите предположиха, че тези мутации са свързани с ниското ниво на молекула, наречена NAD +, която участва в възстановяването на увредената ДНК. Поправянето на AFMID сплайсинг може да доведе до увеличено производство на NAD + и увеличено възстановяване на ДНК. Ако можем да направим това, AFMID шевовете могат да се превърнат в терапевтична цел и източник на нови лекарства за рак на черния дроб. Предварителните експерименти показват, че изследванията на екипа са на прав път и ние очакваме по-добри резултати от данните да са от полза за пациентите с рак на черния дроб.
